計(jì)費(fèi)概述
本文介紹基因分析平臺的計(jì)費(fèi)模式、計(jì)費(fèi)項(xiàng)、關(guān)聯(lián)的其他云產(chǎn)品費(fèi)用。
概述
基因分析平臺是阿里云托管的，完全Serverless化的基因計(jì)算服務(wù)。無需提前創(chuàng)建和管理任何集群，所有資源完全彈性按需，支持從0到千萬的任意樣本規(guī)模，且只需要為實(shí)際使用的付費(fèi)，具有靈活、經(jīng)濟(jì)、管理精細(xì)的產(chǎn)品優(yōu)勢。
計(jì)費(fèi)模式
基因數(shù)據(jù)分析工作通常由一到多個(gè)步驟組成。阿里云基因分析平臺，使用GA4GH支持的流程描述語言WDL，來定義生信分析應(yīng)用，標(biāo)準(zhǔn)化、參數(shù)化地描述每個(gè)步驟所需的計(jì)算資源和執(zhí)行環(huán)境，以及步驟之間的相互依賴關(guān)系。
用戶使用這些分析應(yīng)用提交的運(yùn)行任務(wù)，會被流程執(zhí)行引擎解析成眾多的后端計(jì)算作業(yè)，并由平臺自動(dòng)化、智能化的并行處理，直至任務(wù)完成。
基因分析平臺采用按量付費(fèi)的方式，以運(yùn)行任務(wù)中的計(jì)算作業(yè)為基本單位，對用戶實(shí)際消耗的平臺資源進(jìn)行收費(fèi)。從計(jì)算作業(yè)開始執(zhí)行到完成釋放，按分鐘為單位計(jì)費(fèi)，不滿一分鐘按照一分鐘計(jì)算，實(shí)時(shí)扣費(fèi)，每小時(shí)出賬（賬單出賬時(shí)間通常在當(dāng)前計(jì)費(fèi)周期結(jié)束一小時(shí)后，具體出賬時(shí)間以系統(tǒng)為準(zhǔn)）。
計(jì)費(fèi)項(xiàng)及定價(jià)
單個(gè)計(jì)算作業(yè)使用的平臺資源，可通過分析應(yīng)用中該步驟的運(yùn)行時(shí)屬性指定。其支持的類型規(guī)格和WDL中對應(yīng)的描述定義如下：
資源類型 | 描述 | 規(guī)格說明 | WDL描述定義 | 備注 |
計(jì)算實(shí)例 | 容器、X86、GPU或FPGA等計(jì)算作業(yè)執(zhí)行環(huán)境 | vCPU | cpu:1 | vCPU和內(nèi)存組合使用，且需要滿足使用限制 |
內(nèi)存 | memory:"2G" | |||
ECS實(shí)例 | instanceType:"ecs.c5.xlarge" | 使用ECS實(shí)例時(shí)，會覆蓋vCPU和內(nèi)存設(shè)置 | ||
計(jì)算存儲 | 計(jì)算作業(yè)的本地化的輸入和輸出文件存儲 | NAS容量型 | disks:"local-disk 20G nas_cap" | 可作為數(shù)據(jù)盤使用，參考設(shè)置運(yùn)行時(shí)屬性 |
NAS性能型 | disks:"local-disk 100G nas_per" | |||
ESSD云盤 | disks:"local-disk 100G cloud_essd" | |||
軟件算法 | 計(jì)算作業(yè)使用的軟件工具 | 第三方軟件 | docker: "registry-vpc.cn-shenzhen.aliyuncs.com/easy-gene/genomes-in-the-cloud:1.0" | 只支持阿里云容器鏡像服務(wù)，平臺內(nèi)置的第三方軟件列表。 |
平臺資源對應(yīng)的計(jì)費(fèi)項(xiàng)和定價(jià)：
計(jì)費(fèi)項(xiàng) | 說明 | 定價(jià) | 公測期間優(yōu)惠* |
instance_type | 計(jì)算實(shí)例類型 | 公測期間，計(jì)算數(shù)據(jù)的拉取和回傳以及鏡像的拉取時(shí)間限時(shí)免費(fèi)。 | |
gpu_type | GPU類型 | gc4.medium：13元/小時(shí) gc5.medium：15元/小時(shí) gc7.small：14元/小時(shí) | |
cpu | 核數(shù) | 0.17640 元/核/小時(shí) | |
mem | 內(nèi)存 | 0.02207 元/GiB/小時(shí) | |
nas_cap | NAS容量型 | 0.00049 元/GiB/小時(shí) | |
nas_per | NAS性能型 | 0.0025694 元/GiB/小時(shí) | |
cloud_essd | ESSD云盤 PL0 | 0.001155 元/GiB/小時(shí) | |
cloud_essd_pl1 | ESSD云盤 PL1 | 0.00231 元/GiB/小時(shí) | |
software | 軟件算法 | 第三方軟件定價(jià) |
計(jì)算資源按分鐘計(jì)費(fèi)，不足一分鐘按一分鐘計(jì)算。存儲資源公測期間按分鐘計(jì)費(fèi)，不足一分鐘按一分鐘計(jì)算。
計(jì)費(fèi)示例
以用戶在基因分析平臺中，選擇使用的damo/dna-variant-calling應(yīng)用，分析一個(gè)30x的全基因測序樣本為例。
平臺收費(fèi)明細(xì)如下：
30x WGS測序樣本，~90GBase fastq文件 | ||||||||
使用 damo/dna-variant-calling:v1.0.11 基因分析應(yīng)用，1.53小時(shí)完成費(fèi)用總計(jì) | ||||||||
應(yīng)用步驟 | 作業(yè)并行數(shù) | 運(yùn)行時(shí)長 | 收費(fèi)項(xiàng) | 規(guī)格 | 單價(jià)（元） | 小計(jì)（元） | 單步驟（計(jì)算作業(yè)）費(fèi)用 | 單樣本（運(yùn)行任務(wù)）費(fèi)用總計(jì) |
FastqToVcf | 1 | 1.53h | instance_type | gc5.medium | 15.00 | 22.95 | 23.93 | 23.93 |
nas_per | 250G | 0.0025694 | 0.98 | |||||
software | damo | 0.00 | 0.00 | |||||
單個(gè)計(jì)算作業(yè)計(jì)費(fèi)邏輯如下：
收取費(fèi)用 = （規(guī)格單價(jià) + NAS性能型單價(jià)*NAS容量 + 軟件單價(jià)） * 運(yùn)行時(shí)長
分析應(yīng)用包含的所有步驟對應(yīng)的計(jì)算作業(yè)費(fèi)用累加，即為該樣本在基因分析平臺上的運(yùn)行任務(wù)所需支付費(fèi)用。
其他云產(chǎn)品計(jì)費(fèi)
用戶在基因分析平臺中運(yùn)行分析任務(wù)時(shí)，還需要依賴其他云產(chǎn)品，可能產(chǎn)生其他額外費(fèi)用，說明如下：
依賴云產(chǎn)品 | 用途 | 費(fèi)用類型 | 計(jì)費(fèi)說明 | 備注 |
OSS對象存儲標(biāo)準(zhǔn)型 | 存放基因數(shù)據(jù) | 存儲費(fèi)用 | 按量付費(fèi)0.12元/GB/月，也可以購買資源包 | 查看更多OSS產(chǎn)品資料 |
下載數(shù)據(jù)文件 | 流量費(fèi)用 | 00:00-08:00（閑時(shí)）：0.25元/GB 8:00-24:00（忙時(shí)）：0.50元/GB | ||
ACR容器鏡像服務(wù)個(gè)人版 | WDL中使用的個(gè)人工具鏡像，如不使用Docker則不涉及 | / | 個(gè)人版免費(fèi) | 查看更多ACR產(chǎn)品資料 |