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產品動態

本文介紹基因分析平臺的版本變更信息,包括發布時間、版本變更內容、核心功能特性等信息。

2024年10月

模塊

功能項

子功能點

具體功能項說明

應用倉庫

全基因組選擇

damo/genomic-selection-dataset

【新增】全基因組選擇算法數據集構建

damo/genomic-selection-train

【新增】全基因組選擇算法模型訓練

damo/genomic-selection-pred-self

【新增】全基因組選擇算法自交系表型預測

damo/genomic-selection-pred-f1

【新增】全基因組選擇算法雜交F1代表型預測

2024年9月

模塊

功能項

子功能點

具體功能項說明

應用配置

創建應用(WDL)

runtime

【新增】支持runtime中同時指定多個規格的機器,如type=gc6.small,gc5.medium,gc4.medium

【新增】支持runtime中直接聲明磁盤大小(此時默認使用nas_cap數據盤類型)

【新增】runtime中支持cloud_essd、cloud_essd_pl1、nas_per、nas_cap四種數據盤類型

【新增】runtime中支持通過env指定掛載oss bucket(兼容掛載同賬號和跨賬號的oss bucket)

【新增】runtime中支持設置sentieon license環境變量的方式使用sentieon

運行選項設置

【新增】支持選擇數據加載模式為掛載或下載(前端默認掛載)

應用倉庫

變異分析

sentieon

【更新】sentieon需要通過設置sentieon license環境變量的方式繼續使用

序列比對

damo/vardict

【新增】CPU并行加速的vardict

damo/bwa-mem2

【新增】基于云優化的bwa-mem2

damo/bwa-mem2-index

【新增】bwa-mem2索引構建

damo/blastn

【新增】基于云優化的blastn

damo/blastn-makedb

【新增】blastn數據庫構建

2024年8月

模塊

功能項

子功能點

具體功能項說明

應用倉庫

序列比對

damo/align-markdup-bqsr

【新增】GPU版本序列比對排序去重bqsr

變異識別

damo/haplotype-calling

【新增】GPU版本HaplotypecCaller

序列壓縮

damo/fqcompress

【新增】高壓縮比的fastq壓縮

damo/fqdecompress

【新增】高壓縮比的fastq解壓

變異識別索引

damo/dna-index

【新增】GPU變異分析流程索引構建

2024年6月

模塊

功能項

子功能點

具體功能項說明

應用倉庫

群體變異識別

damo/dna-variant-calling

【新增】GPU變異分析流程

damo/joint-calling

【新增】CPU+GPU群體變異分析流程

2021年5月

發布時間

版本變更內容

核心功能特性

2021-05-28

基因分析平臺公測發布

  • 生信流程開發、版本化管理和計算分析,支持WDL語言標準

  • 無服務基因計算引擎,支持任意規模樣本數據處理

  • 支持CPU/MEM細粒度計算資源,智能計算調度

  • 集成Sentieon第三方商業軟件,提供DNAseq,Joint Calling等公共流程